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Text File  |  1995-03-04  |  1.7 KB  |  34 lines
  1. *************************************
  2. * Glutamyl-tRNA reductase signature *
  3. *************************************
  4.  
  5. Delta-aminolevulinic acid (ALA) is  the obligatory precursor for the synthesis
  6. of  all tetrapyrroles  including porphyrin derivatives such as chlorophyll and
  7. heme.  ALA can be synthesized  via  two different pathways: the Shemin (or C4)
  8. pathway which involves  the  single  step  condensation  of  succinyl-CoA  and
  9. glycine and which  is  catalyzed by ALA  synthase (EC 2.3.1.37) and via the C5
  10. pathway from the five-carbon skeleton of glutamate.  The C5  pathway  operates
  11. in the chloroplast of  plants and algae,  in cyanobacteria, in some eubacteria
  12. and in archaebacteria.
  13.  
  14. The initial step in the C5 pathway is carried out  by  glutamyl-tRNA reductase
  15. (GluTR) [1]  which  catalyzes  the  NADP-dependent  conversion  of  glutamate-
  16. tRNA(Glu)  to  glutamate-1-semialdehyde (GSA) with  the concomitant release of
  17. tRNA(Glu)  which  can  then  be  recharged  with  glutamate  by  glutamyl-tRNA
  18. synthetase.
  19.  
  20. GluTR is a protein of about 50 Kd (515 to 550 residues)  which  contains a few
  21. conserved region.  The best conserved region is located in positions 99 to 122
  22. in the sequence of  known GluTR.  This region seems important for the activity
  23. of the enzyme.  We have  developed a  signature  pattern  from  that conserved
  24. region.
  25.  
  26. -Consensus pattern: H-L-x(2)-V-[GSAC](3)-[LIVM]-[DE]-S-[LIVM](3)-G-E-x-Q-I-L-
  27.                     [AG]-Q-V-[KR]
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  30. -Last update: December 1992 / First entry.
  31.  
  32. [ 1] Jahn D., Verkamp E., Soll D.
  33.      Trends Biochem. Sci. 17:215-218(1992).
  34.